Должен быть совместим. По крайней мере на версиях Pro/Engineer Wildfire 2.0 билды совместимы.
Возможно именно версия М00 не совместима, потому что врятли такой маленький билд будут внедрять в работу. Слишком сыроват.
Да и может быть речь все же о билдах M040 и M050 (последний нолик тоже играет важную роль),а не о M04 и M05.